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Microbiologia

Licenciatura de Biologia, 2007/8

Avisos

Estão disponíveis a pauta provisória, onde se incluem os resultados da época normal, e comentários às perguntas de resposta livre, que deverão ajudar a responder às que serão apresentadas na época de recurso..
Foi detectada uma pequena incorrecção no texto especial de apoio, pelo que é recomendável substituir a versão anterior.

Informação

Está disponível neste local, para consulta, a correcção das perguntas da frequência, parte teórica (excepto a pergunta de resposta livre).

Paulo de Oliveira

Calendário

Início das aulas: 26 de Fevereiro.

1ª frequência: 2 de Maio às 19 e 30, salas 129 e 134 (CLV).

2ª frequência: 25 de Junho às 10 e 30, anfiteatros 2 e 3 (CLV).

Exame, época normal: 25 de Junho às 10 e 30, anfiteatros 2 e 3 (CLV).

Exame, época de recurso: 10 de Julho às 10h30, salas 129 e 135 (CLV).

Regime de avaliação

Componente de provas individuais (duas frequências ou exame final): 60% da nota final.

Nota mínima em qualquer das provas: 8,0 valores (sem arredondamentos).

Na época de recurso há apenas um exame final.

Supletivamente, autoriza-se melhoria da nota nesta componente, na época de recurso, a quem tenha obtido aprovação na época normal.

Todas as frequências e exames incluem algumas perguntas das aulas práticas.

Sobre a utilização das notas das frequências/exames teóricos de 2006/7, ver esclarecimento abaixo.

Componente de relatórios em grupo: 40% da nota final

Nota mínima em cada relatório: 8,0 valores (sem arredondamento); nota mínima na média dos relatórios: 10,0 valores (sem arredondamento).

As componentes onde já tenha sido obtido aproveitamento em anos lectivos anteriores (quer relatórios, quer frequências/ exames) vigoram para melhoria de nota (com a outra componente), se dentro dos prazos estabelecidos originalmente. Assim, quem tenha obtido aproveitamento na componente relatórios em 2005/6 ou posteriormente fica dispensado de frequentar as aulas práticas (embora possa fazê-lo se quiser também melhorar nesta componente)
Alunos que tenham obtido aproveitamento nas frequências ou exames no ano lectivo 2006/7 também podem prescindir dessa componente de avaliação.

Neste contexto, os critérios de aproveitamento são exclusivamente os que se aplicam no corrente ano lectivo, explicitados acima.

Daí que se deva esclarecer ainda o seguinte: não existindo este ano um exame prático separado do teórico, mas sim algumas perguntas das aulas práticas incluídas nas frequências e exames, previnem-se os alunos que pretendem usar a nota que obtiveram em 2006/7 à componente das teóricas de que essa nota só corresponde a uma parte das frequências e exames no ano corrente. Devem por isso também comparecer a estas provas, calendarizadas acima, onde lhes será permitido realizarem apenas a componente de práticas.

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Programa

Introdução

Bacteria

Proteobacteria

Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon

Firmicutes s. l.

Bacilli, Clostridia, Mollicutes

Actinobacteria
Bacteroidetes
Chlorobi (Chlorobea)
Cyanobacteria
Spirochaetes
Outros grupos Gram-negativo

Planctomycetes, Chlamydiae, e "clades-mistério": Verrucomicrobia, Deferribacteres, Acidobacteria

Grupos "primitivos"

Aquificae, Thermotogae, Deinococcus-Thermus, Chloroflexi

Evolução

Archaea

Introdução

Euryarchaeota
Crenarchaeota e outros

Eucarya

Introdução

Unikonta

Amoebozoa, Ophistokonta.

Bikonta

Archaeplastida, Chromalveolata, Excavata, Rhizaria.

Vírus

Métodos de estudo

Microscopia
Genética
Quimiotaxonomia
Culturas

Culturas de referência, fases de crescimento, sistemas abertos, controlo do crescimento, meio sólido, meios selectivos, monitorização ambiental.

Adaptação

Meios aquáticos. Meios terrestres. Extremos ambientais. Simbioses.

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Seminários

(presença dos autores a confirmar)

Materiais didácticos

Área no m o o d l e (só acessível para os alunos inscritos).

Acompanhamento com perguntas de revisão

1ª semana   2ª semana   3ª semana   4ª semana   5ª semana   6ª semana   7ª semana   8ª semana   9ª semana   10ª semana   11ª semana  12ª semana  13ª semana

Texto especial de apoio

Modelos de metabolismo energético em procariotas

Materiais suplementares

(incluem conceitos que não são objecto de avaliação, mas a sua consulta pode ser útil em matérias que são relevantes para a mesma)

Imagens projectadas nas aulas teóricas  

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Livros

Para os alunos que desejem adquirir um livro para esta Unidade Curricular, recomenda-se:
Madigan, M., & Martinko, J. Brock Biology of Microorganisms, 11th Ed. (Prentice Hall, 2005). ISBN 0131443291.
Portal de referência. O Companion Web site requer senha de acesso.

Buscas na Biblioteca da Universidade de Évora: tema Microbiologia CDU 579

Algumas sugestões, disponíveis na Biblioteca da Universidade de Évora:

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Links

Métodos de busca na World Wide Web

A obra de van Leeuwenhoek, e outro texto sobre este assunto.
Colecção de textos de Pasteur, que também são listados no Internet Modern History Sourcebook.
Colecção de artigos clássicos de Koch (tuberculose), Gram (coloração Gram), Beijerinck (fixação de Azoto) e Winogradsky (nitrificação)
Um comentário sobre os pioneiros da investigação do vírus do mosaico do tabaco.
Dois artigos clássicos do trabalho de Carl Woese e colegas.
O artigo clássico de Thomas Brock sobre formas de vida adaptadas a temperaturas elevadas.
Uma resenha actualizada da importância da investigação microbiológica na agricultura, pecuária e segurança alimentar.

Um e-livro introdutório sobre Microbiologia editado por Timothy Paustian (2002).
The World of Microbes é outro e-livro, muito bem organizado, abrangente e actualizado. Ver por exemplo o capítulo 2.
Uma colecção de textos gerais de Microbiologia: Todar's Online Textbook of Bacteriology e Ken Todar's Microbial World
Aulas de diversidade microbiana na Universidade de Carolina do Norte.
E-escola, colecção de textos didácticos do Instituto Superior Técnico.
Microbiology for Teachers, dá acesso a extensas listas de definições.
Arquivo da publicação mensal da American Society for Microbiology, que em cada número tem na secção Features (entre outras) leituras de grande interesse.
Microbewiki, enciclopédia mantida por estudantes da Universidade de Kenyon.
Introdução à classificação dos procariotas e acesso à nomenclatura corrente.
Capítulo de introdução do Taxonomic Outline of the Bacteria and Archaea e acesso ao conteúdo completo

Phototèque de imagens de microscopia de bactérias e antibiogramas, do site BACTERIO-WEB.
Uma revisão aprofundada sobre os flagelos bacterianos, por Howard Berg (2000).
Imagens, algumas animadas, de estrutura e movimento dos flagelos bacterianos e eucarióticos. Ver também uma introdução à polémica antievolucionista da origem dos flagelos bacterianos, como base de compreensão para o detalhado artigo de Matzke (Evolution in (Brownian) space: a model for the origin of the bacterial flagellum), donde se extraíram algumas das imagens mostradas sobre comparações com estruturas evolutivamente homólogas.
Cromossomas bacterianos: diversidade da organização genómica em bactérias (parte dum excelente conjunto de recursos online de genética microbiana da Universidade de San Diego (Stanley Malloy).

Molecule of the Month, uma série de artigos sobre biomoléculas, exaustivo mas de leitura muito fácil. Sugere-se por exemplo o do chamado Oxygen Evolving Complex (Junho de 2006).
The KEGG Pathway Database, referência online para vias metabólicas, famílias estruturais de proteínas, etc.. Uma alternativa é na Biocatalysis/biodegradation database, e outra é a base de dados MetaCYC. Um ponto de partida alternativo, com acesso a muitos diagramas de cada via metabólica, encontra-se em Answers.com
Microbial structure and function, curso do King's College onde se disponibilizam alguns apontamentos detalhados sobre metabolismo.
Conjunto de animações ilustrando algumas vias metabólicas.
BioCYC, versão que integra a informação da MetaCYC com outras bases de dados, nomeadamente genómicas.
Documento da FAO sobre utilização de microorganismos (incluindo metanogénios) na produção sustentável de energia. Ver também o capítulo Micro-organisms as tools for rural processing of organic residues extraído do livro Bioconversion of Organic Residues for Rural Communities eidtado pela ONU, datado de 1979 mas ainda uma boa referência.
Uma panorâmica dos testes microbiológicos que se utilizam, e uma explicação simples do diagnóstico diferencial de enterobactérias.
Adaptação osmofílica.
Revisão sobre o metabolismo do Enxofre em bactérias.

Fungos (Tree of Life); ver também um site didáctico da Universidade de Évora.
Cianobactérias.
Líquenes.
Chlamydiales.
Anammox.
A imagem ao lado contém um link para aceder ao livro Ending the War Metaphor, boa revisão de conceitos sobre simbioses publicada em 2006. Basta fazer uma inscrição para ele ficar disponível.
Colecção de vídeos representando os ciclos de infecção de Legionella pneumophila, Listeria monocytogenes e Mycobacterium tuberculosis (43 MB).
Flora bacteriana do corpo humano.
Exemplos de páginas sobre Microbiologia da Universidade de Brasília: biofilmes, Archaea.
Excelentes colecções de fotos de eucariotas microscópicos: Protist Digital Specimen Archive (Japan Science and Technology Corporation), Micrographia, e o The Micropolitan Museum (mantida por Wim van Egmond).
Fungos.
Dois artigos de referência sobre a classificação dos eucariotas e sobre a classificação das plantas.

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